PrimeMate: เครื่องมือสร้างโปรแกรม PrimeMate ที่รวดเร็วและเรียบง่ายสำหรับ Ensembl
PrimeMate เป็นส่วนเสริมของ Chrome ที่พัฒนาโดย PrimeMate ที่ให้บริการเป็นตัวสร้างโพรไมเมอร์สำหรับ Ensembl โดยผู้ใช้สามารถสร้างคู่โพรไมเมอร์ได้หลายร้อยคู่ด้วยพารามิเตอร์ที่กำหนดเองและเรียงลำดับตามความชอบของพวกเขา
ด้วย PrimeMate ผู้ใช้สามารถทำงานกับฐานข้อมูลเชิงพันธุกรรม Ensembl ได้อย่างง่ายดายโดยเพียงเลือกที่จะไปยังลำดับที่ต้องการและคลิก "ค้นหาโพรไมเมอร์" ส่วนเสริมนี้มีตัวเลือกที่กำหนดเองได้หลากหลาย เช่น ความยาวผลิตภัณฑ์ที่เหมาะสมที่สุด อุณหภูมิการละลาย ความเข้มข้นของ G/C และค่าเกณฑ์การเกิดไดเมอร์/เกิดผมเกินขนาดที่กำหนด
หนึ่งในคุณสมบัติที่โดดเด่นของ PrimeMate คือความสามารถในการแสดงข้อมูลอย่างละเอียดสำหรับผลิตภัณฑ์แต่ละชิ้น เช่น ความยาว อุณหภูมิการละลาย และตำแหน่งอิโกน ผู้ใช้ยังสามารถเรียงลำดับผลลัพธ์ที่ได้ตามเกณฑ์ที่ต้องการได้โดยปรับน้ำหนักการเรียงลำดับสำหรับแต่ละตัวแปร
PrimeMate ยังสามารถกรองผลิตภัณฑ์ที่ไม่ต้องการโดยอัตโนมัติ เช่น โพรไมเมอร์ที่เกิดไดเมอร์เองหรือโพรไมเมอร์ที่ตำแหน่งบนลำดับไม่เหมาะสม นอกจากนี้ยังมีตัวเลือกให้บันทึกลำดับที่ผู้ใช้เลือกไว้ในแถว "รายการโปรด" เพื่อให้เข้าถึงได้ง่ายและสามารถแบ่งปันได้อย่างราบรื่นโดยการคัดลอกลำดับไปยังคลิปบอร์ด
โดยรวมแล้ว PrimeMate เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพและมีประสิทธิภาพสำหรับการสร้างโพรไมเมอร์ใน Ensembl โดยมีอินเตอร์เฟซที่ใช้งานง่ายและมีตัวเลือกที่กำหนดเองได้หลากหลาย
